Ежегодно под эгидой и при участии Томского научного центра СО РАН проводятся большиe праздники.

8 февраля, когда отмечается День российской науки , каждый из институтов, расположенных на территории томского Академгородка, распахивает свои двери для всех желающих. В рамках дня открытых дверей возможность посетить институтские лаборатории и послушать лекции ведущих ученых получает будущая смена – учащиеся Академического лицея.

В Конгресс-центре «Рубин» проходит концерт известных российских артистов, а в Доме ученых артистами становятся сами ученые, свои певческие, хореографические и театральные таланты они показывают на «Необыкновенно-научном концерте».

Вот уже много лет проходит приуроченный ко Дню науки лыжный кросс памяти академика В.Е. Зуева, основателя Томского научного центра СО РАН и страстного поклонника этого вида спорта. Помериться силами на лыжню выходят сотрудники всех академических учреждений, сильнейшие их которых отправляются на Академиаду РАН по лыжным гонкам.

Площадкой для празднования Дня Победы , 9 мая в Академгородке становится Аллея Славы, открытая в 1985 году в честь 40-летия Победы. Здесь организуется прямая трансляция Парада Победы на Красной Площади в Москве. В концертной программе – духовой оркестр и песни военных лет. Каждый может отведать солдатской каши из настоящей полевой кухни, поупражняться в разборке и сборке стрелкового оружия, посмотреть парад военной ретро-техники. По-своему присоединяется Академгородок и к международной акции «Бессмертный полк». На специальном стенде «Наш бессмертный полк» каждый может разместить фотографию своего фронтовика. Организатором праздника на Аллее Славы выступает коллектив Конгресс-центра «Рубин».

В июне проходит праздник территории – День Академгородка . Впервые он состоялся в 2008 году по инициативе чл.-корр РАН С.Г. Псахье, в то время председателя Президиума ТНЦ СО РАН. Традиционно, участники праздника собираются на месте основания Академгородка – на площади перед его первым институтом, Институтом оптики атмосферы СО РАН. После возложения цветов к памятной стеле основателя Академгородка академика В.Е. Зуева костюмированная колонна направляется по проспекту Академическому к площади перед поликлиникой, где проходит торжественная «линейка». Далее торжество перемещается на Летнюю эстраду, где команды институтов соревнуются в конкурсе веселых и находчивых, перед зрителями выступают творческие коллективы Академгородка. На всех спортивных площадках выясняют, кто быстрее, выше, сильнее. Например, на протяжении многих лет в Академгородке проходил благотворительный турнир по баскетболу на призы Александра Кауна, бронзового призера Олимпийских игр в Лондоне и первого российского чемпиона НБА. Завершается День Академгородка рок-концертом и фейерверком. На протяжении всех десяти лет основную работу по организации праздника берет на себя коллектив Дома ученых Академгородка.

Каждое из этих событий давно стало доброй традицией и по-настоящему объединяет людей, ученых и жителей Академгородка.